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“中国历史文献总库·医学文献数据库”由国家图书馆出版社开发，旨在将建国以前的医学文献进行系统整合和集中发布，为医学的科研和教学提供服务。收录图书4113余种，期刊95种、古籍1000种，文献量超过120万页。
医学图书：上线4113余种，依据内容按照分为，一般理论、中国医学、基础医学、预防医学、卫生学、教育教学、药学、医学机构团体、外科学、内科学、儿科学、妇产科学、眼科学、特征医学、口腔科学、神经病学与精神病学、皮肤科学与性病学、医学丛书等19个大类，几乎涵盖了这一时期的全部医学图书。
所有图书均可实现全文检索，全文检索采用检索结果预览，点击后在图像中精确定位的方式，大大提高文献的利用效率。此外，还提供任意词、书名、作者、出版者、出版年、出版地、关键词等检索；可通过图书分类进行导航，浏览该类别全部图书；检索结果可自动按图书分类、作者、出版社、出版年进行聚合；检索结果可按书名、作者、出版年进行排序。
医学期刊：上线近95种，既包括北京出版的《中国医药月刊》《中华民国医药学会会报》《协医校刊》，上海出版的《同济医学月刊》《国医文献》，南京出版的《国医公报》《医学》等重要刊物，也包括“左联”等革命团体在国统区出版的进步刊物，反映了从中国共产党创建到新中国成立的全过程。
期刊提供按刊检索、按篇检索、高级检索三种维度的检索。其中按刊检索检索项为任意词、刊名、编者、出版者、出版地、出版年；按篇检索检索项为任意词、篇名、作者；具备高级检索功能，可以进行组合检索；可通过期刊分类进行导航，浏览该类别全部期刊。
检索特定篇目，点击进行阅读时，可直接在整期中进行定位。期刊篇目在左侧导航栏显示，方便使用者进行期内篇目的跳转，一览期刊全貌。避免了同类数据只能显示单篇信息，无法与整期同时显示的问题。在左侧篇目栏特别增加了下载按钮，使用者浏览时发现研究所需的篇目，可随时进行下载，不用再返回主页面进行检索。
医学古籍：共上线1000种，包括了《神农本草经》《黄帝内经素问》《黄帝内经灵枢》《伤寒论》《新修本草》《千金要方》《政和新修经史证类备用本草》等研究价值和史料价值极高的珍本医学类古籍。古籍库以《中国古籍总库》子部医家类的分类为依据，结合数据库的展示方式，以多级分类浏览的形式，有条理地展现医学古籍。
